1. Основні дослідження нуклеїнових кислот: геномне клонування
2. Асиметрична ПЛР для підготовки одноланцюгової ДНК для секвенування ДНК
3. Визначення невідомих ділянок ДНК методом зворотної ПЛР
4. ПЛР зі зворотною транскрипцією (RT-PCR) використовується для визначення рівня експресії генів у клітинах, кількості РНК вірусу та прямого клонування кДНК певних генів.
5. Флуоресцентна кількісна ПЛР використовується для моніторингу продуктів ПЛР у реальному часі
6. Швидка ампліфікація кінців кДНК
7. Виявлення експресії генів
8. Медичне застосування: виявлення бактеріальних та вірусних захворювань; діагностика генетичних захворювань; діагностика пухлин; застосовані до судових доказів