1. Základný výskum nukleových kyselín: genómové klonovanie
2. Asymetrická PCR na prípravu jednovláknovej DNA na sekvenovanie DNA
3. Stanovenie neznámych oblastí DNA pomocou inverznej PCR
4. Reverzná transkripčná PCR (RT-PCR) sa používa na detekciu úrovne expresie génov v bunkách, množstva RNA vírusu a priameho klonovania cDNA špecifických génov
5. Fluorescenčná kvantitatívna PCR sa používa na monitorovanie produktov PCR v reálnom čase
6. Rýchla amplifikácia koncov cDNA
7. Detekcia génovej expresie
8. Lekárske aplikácie: detekcia bakteriálnych a vírusových ochorení; diagnostika genetických chorôb; diagnostika nádorov; aplikované na forenzné dôkazy