1. Podstawowe badania kwasów nukleinowych: klonowanie genomu
2. Asymetryczna PCR w celu przygotowania jednoniciowego DNA do sekwencjonowania DNA
3. Oznaczanie nieznanych regionów DNA metodą odwrotnej PCR
4. PCR z odwrotną transkrypcją (RT-PCR) służy do wykrywania poziomu ekspresji genów w komórkach, ilości wirusa RNA oraz bezpośredniego klonowania cDNA określonych genów
5. Fluorescencyjny ilościowy PCR służy do monitorowania produktów PCR w czasie rzeczywistym
6. Szybka amplifikacja końców cDNA
7. Wykrywanie ekspresji genów
8. Zastosowania medyczne: wykrywanie chorób bakteryjnych i wirusowych; diagnostyka chorób genetycznych; diagnostyka nowotworów; stosowane do dowodów kryminalistycznych