1. Nukleiinihappojen perustutkimus: genominen kloonaus
2. Asymmetrinen PCR yksijuosteisen DNA:n valmistamiseksi DNA-sekvensointia varten
3. Tuntemattomien DNA-alueiden määritys käänteis-PCR:llä
4. Käänteistranskriptio-PCR:tä (RT-PCR) käytetään solujen geeniekspression tason, RNA-viruksen määrän ja tiettyjen geenien cDNA:n suoran kloonauksen havaitsemiseen.
5. Fluoresenssikvantitatiivista PCR:ää käytetään PCR-tuotteiden reaaliaikaiseen seurantaan
6. cDNA-päiden nopea monistuminen
7. Geeniekspression havaitseminen
8. Lääketieteelliset sovellukset: bakteeri- ja virustautien havaitseminen; geneettisten sairauksien diagnosointi; kasvainten diagnosointi; sovellettu oikeuslääketieteellisiin todisteisiin