1. Recerca bàsica sobre àcids nucleics: clonació genòmica
2. PCR asimètrica per preparar DNA monocatenari per a la seqüenciació de DNA
3. Determinació de regions d'ADN desconegudes per PCR inversa
4. La PCR de transcripció inversa (RT-PCR) s'utilitza per detectar el nivell d'expressió gènica a les cèl·lules, la quantitat de virus ARN i la clonació directa d'ADNc de gens específics.
5. La PCR quantitativa de fluorescència s'utilitza per al seguiment en temps real dels productes de PCR
6. Amplificació ràpida dels extrems de l'ADNc
7. Detecció de l'expressió gènica
8. Aplicacions mèdiques: detecció de malalties bacterianes i víriques; diagnòstic de malalties genètiques; diagnòstic de tumors; aplicat a proves forenses